专论与研究

昆明市售稻米的DNA指纹及其聚类分析

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  • 云南农业大学稻作研究所,云南 昆明 650201

网络出版日期: 2011-11-20

基金资助

云南省科技计划(2009BB007)

DNA Fingerprint and Genotype Clustering Analysis of Milled Rice Sold on Kunming Market

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Online published: 2011-11-20

摘要

用改良的SDS法提取昆明市主要销售27个稻米样品的总DNA,从70对PCR引物筛选出7对多态性高、带型清晰的引物对稻米样品DNA进行基因型分析,构建了DNA指纹图谱;应用NTSYS软件进行相似性系数计算,利用UPGMA法构建聚类树状图。结果表明,这7个引物得到的DNA指纹图谱基本能将27个供试样本区分开,DNA标记的聚类分析基本能区分出市售稻米的籼粳类型。结果不但可为市售稻米品种真假鉴别、打击冒牌行为提供技术支持,也可为稻米品种的亲缘关系的分析和市售稻米的指纹图谱数据库建立提供参考。

本文引用格式

成晨, 徐津, 谭学林* . 昆明市售稻米的DNA指纹及其聚类分析[J]. 中国稻米, 2011 , 17(6) : 53 -57 . DOI: 10.3969/j.issn.1006-8082.2011.06.016

参考文献



[1]  严文明. 中国稻作农业的起源[J]. 农业考古,1982(2):50-54.

[2]  金伟栋,洪德林. 杂交水稻品种指纹鉴定研究进展[J]. 上海农业学报,2006,22(1):104-108.

[3]  刘旭. 遗传标记和遗传图谱的构建[J]. 作物品种资源,1997(3):29-32.

[4]  杨旭,谭学林. 滇型杂交水稻主要亲本的SSR指纹图谱及其遗传差异分析[D]. 云南农业大学.

[5]  段世华,毛加宁,朱英国. 用微卫星DNA标记对我国杂交水稻主要恢复系遗传差异的检测分析[J]. 遗传学报,2002,29(3):250-254.

[6]  王力新,李云伏,赵昌平,等. 建立小麦品种DNA指纹的方法研究[J]. 作物学报,2007,33(10):1738-1740.

[7]  宣云,赵伟,宋丰顺,等. 利用SSR标记分析部分粳稻品种的遗传多样性[J]. 核农学报,2007,21(3):217-220.

[8]  Nei M. Molecular evolutionary genetics[M]. New York :Columbia University Press,1987: 190-191.

[9]  Sokal R R,Michener C D. A statistic method for evaluating systematic relationships[J]. Sci Bull Univ Kanas,1958,28:1409-1439.

[10]  McDonald M B,Elliot L J,Sweeney P M. DNA extraction from dry seed for RAPD analyses in varietal identification studies[J]. Seeds Sci Tech,1994,22(1):171-176.

[11]  Chunwongse J,Martin G B,Tanksley S D. Pregermination genotypic screening using SSR amplification of half-seeds[J]. Theor Appl  Genet,1993,86(6):694-698.

[12]  彭锁堂,庄杰云,颜启传,等. 水稻单粒种子DNA提取及RAPD程序优化研究[J]. 上海交通大学学报,2002,20(1):34-37.

[13]  程保山,万志兵,洪德林. 35个粳稻品种SSR指纹图谱的构建及遗传相似性分析[J]. 南京农业大学学报,2007,30(3):1-6.

[14]  李莉,宋书锋,刘全胜,等. 利用SSR分子标记建立杂交水稻指纹图谱[J]. 长江大学学报,2008,5(4):98-103.

[15]  Nagraraju J,Kathirvel M,Rammesh Kumar R,et al. Genetic analysis of traditional and evolved Basmati and non-Basmatic rice varieties by using fluorescence-based ISSR-SSR and SSR markers[J]. PNAS,2002,99(9):5836-5841.
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